珍珠状阴茎丘疹一般无需特殊治疗，若有治疗需求可考虑以下方式。目前并没有特效的单一药物能完全根治珍珠状阴茎丘疹。
物理治疗方法
激光治疗： 利用激光的高能量破坏病变组织。通常治疗时会有局部轻微灼热感，一般1 - 2周创面可愈合。但要注意治疗后保持局部清洁干燥，避免感染。冷冻治疗： 通过低温使病变组织坏死脱落。冷冻后局部可能出现水肿、水疱，一般1 - 2周水疱干涸结痂脱落。治疗后要防止感染，创面尽量不要沾水。
局部外用药情况
莫匹罗星软膏： 如果珍珠状阴茎丘疹伴有局部感染情况，莫匹罗星软膏可起到抗感染作用。它能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥抗菌功效。但使用时要注意涂药范围不宜过大，且对莫匹罗星过敏者禁用。红霉素软膏： 也可用于可能出现感染的珍珠状阴茎丘疹局部。它对革兰阳性菌有较强抗菌作用，能抑制细菌生长。使用时同样要注意局部皮肤的反应，若出现红肿、瘙痒加重等过敏表现应停药。
日常注意事项
保持局部清洁： 每天用温水清洗阴茎部位，保持局部清洁卫生，降低感染风险。清洗时动作要轻柔，避免过度刺激。穿宽松内裤： 选择棉质、宽松的内裤，减少局部摩擦。这样可以让阴茎处于相对舒适、透气的环境中，利于丘疹的恢复。