有排卵但是不来月经可能由多种原因引起，其中常见的是子宫内膜问题。比如宫腔粘连，这是由于宫腔操作（如人工流产）等导致子宫内膜损伤，约15% - 25%的宫腔粘连会出现有排卵但不来月经的情况。
内分泌失调因素
多囊卵巢综合征：这是一种常见的内分泌疾病，约占无排卵性不孕的70%。患者体内雄激素水平升高，会影响子宫内膜的正常生长，导致有排卵但月经稀发甚至闭经。一般通过检查性激素六项等可辅助诊断。甲状腺功能异常：甲状腺激素对月经周期有调节作用。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，约10% - 20%的甲状腺功能减退患者会出现月经紊乱，表现为有排卵但不来月经。
子宫病变相关
子宫内膜结核：由结核杆菌感染子宫内膜引起，会破坏子宫内膜的正常结构和功能，导致内膜受损，影响月经来潮。有过结核病史或者接触过结核患者的人群需警惕。子宫发育不良：部分女性子宫发育比正常偏小，子宫内膜增生不够，即使有排卵，也可能出现不来月经的情况。这种情况在青春期女性中相对常见。
精神心理因素
长期精神压力大：当人长期处于高压力状态下，如工作压力、生活重大事件等，会影响下丘脑分泌促性腺激素释放激素，进而影响垂体分泌促性腺激素，导致有排卵但月经失调，不来月经。研究发现，长期精神压力超过3个月的人群，约5% - 10%会出现这种月经异常情况。过度减肥：过度节食减肥的女性，身体摄入营养不足，脂肪含量过低，会影响雌激素的合成，从而影响子宫内膜的生长，导致有排卵但不来月经。一般体重下降超过正常体重的10% - 15%时，就可能出现月经紊乱。