免疫性脑炎的治愈率因多种因素而异，一般来说，约60%~70%的患者经过及时规范的治疗可以获得较好的预后。
影响治愈率的因素
病情发现的早晚：
早期发现的优势： 如果免疫性脑炎在发病初期就被准确诊断并开始治疗，治愈率相对较高。因为此时脑部受损程度相对较轻，及时干预能有效控制病情进展。例如，发病后1~2周内接受规范治疗的患者，康复概率往往比延误诊治数周才开始治疗的患者要高很多。晚期发现的挑战： 若病情发现较晚，脑部已经遭受较为严重的损伤，那么治愈率会受到一定影响。此时不仅治疗难度加大，患者康复后可能遗留不同程度的认知、运动等功能障碍。
治疗方案的选择：
一线治疗药物： 常用的有糖皮质激素，如甲泼尼龙等。通过抑制免疫反应来减轻脑部炎症。一般来说，规范使用糖皮质激素治疗的患者，部分可以获得较好的恢复。但具体效果因个体差异有别。比如，对于一些由自身抗体介导的免疫性脑炎患者，早期足量使用甲泼尼龙等糖皮质激素，约有60%左右的患者能取得较好的病情控制。其他治疗手段： 有时候还会联合使用免疫球蛋白等治疗方法。如果能根据患者具体情况选择合适的综合治疗方案，也有助于提高治愈率。但如果治疗方案选择不当，可能会影响治愈率。
患者自身的身体状况：
年龄因素： 儿童患者相对成人可能有一定优势，儿童的身体修复能力相对较强。一般儿童免疫性脑炎患者在经过积极治疗后，治愈率相对较高，可达70%左右。而老年患者由于身体机能衰退，恢复能力相对较弱，治愈率可能会低于中青年患者，约50%~60%。基础健康状况： 本身没有其他严重基础疾病的患者，治愈率相对更高。比如一个平时身体健康、没有心脑血管等基础疾病的免疫性脑炎患者，经过治疗后康复的概率比本身有糖尿病、高血压等基础疾病的患者要高。因为基础疾病可能会影响身体对治疗的耐受性以及康复进程。