手指关节疼痛的原因可能有以下几点：
1.关节炎：手指关节炎是最常见的原因之一，可分为类风湿性关节炎和骨关节炎。类风湿性关节炎多发生在35-50岁女性，典型表现为手指近端指间关节、掌指关节等多关节肿痛，伴有晨僵，可伴有腕、肘、肩、膝、髋、踝关节肿痛；骨关节炎可发于全身各个关节，手的骨关节炎好发于远端指间关节，也可累及近端指间关节，可出现手指关节疼痛、肿胀、僵硬、畸形。
2.感染：手指关节感染也可导致疼痛，如化脓性指头炎、腱鞘炎等。
3.创伤：手指关节受到直接或间接的创伤，如扭伤、骨折等，可导致疼痛和肿胀。
4.代谢性疾病：痛风、假性痛风等代谢性疾病也可引起手指关节疼痛。
5.自身免疫性疾病：系统性红斑狼疮、干燥综合征等自身免疫性疾病可累及全身多个系统和脏器，当累及手指关节时，可出现疼痛、肿胀、畸形等表现。
6.其他：手指关节疼痛还可能与肿瘤、内分泌紊乱、神经病变等有关。
需要注意的是，手指关节疼痛的原因较为复杂，可能是多种因素共同作用的结果。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。