新生儿喉鸣多是喉部结构或功能异常导致，常见原因有先天性喉软骨软化症，约50%以上的新生儿喉鸣由它引起。
先天性喉软骨软化症导致的喉鸣
解剖结构异常： 胎儿在发育过程中，喉软骨发育不良，如会厌软骨软弱、杓状会厌襞组织松弛等，吸气时喉部组织塌陷，就会产生喉鸣。一般出生后不久就出现，有的新生儿出生1 - 2个月时症状明显，随着年龄增长，喉软骨逐渐发育成熟，症状多在18 - 24个月缓解。喂养相关影响： 这类新生儿在吃奶时可能会加重喉鸣，因为吃奶过程中需要协调呼吸和吞咽，喉部组织的运动可能受影响，导致气道狭窄更明显。
先天性喉囊肿或喉蹼引起的喉鸣
先天性喉囊肿： 喉部出现囊性肿物，会占据气道空间，影响气流通过，从而产生喉鸣。囊肿大小不同表现可能有差异，小的囊肿可能症状相对较轻，大的囊肿可能导致明显的呼吸困难和喉鸣，且可能会逐渐增大，影响新生儿的正常呼吸。先天性喉蹼： 喉部出现膜状组织，将喉部部分或完全阻塞，导致气道狭窄，引起喉鸣。喉蹼的程度不同，症状轻重不一，严重的喉蹼可能在出生后就出现严重的呼吸困难和喉鸣，需要及时干预处理。
呼吸道感染导致的喉鸣
感染引发喉部炎症： 新生儿免疫力较低，容易发生呼吸道感染，如感冒等，炎症会引起喉部黏膜肿胀、分泌物增多，导致气道狭窄，出现喉鸣。一般会伴随其他呼吸道感染症状，如咳嗽、流涕等，感染控制后，喉部炎症消退，喉鸣多会缓解。例如，病毒感染引起的上呼吸道感染导致的喉鸣，经过抗病毒及对症治疗，通常在感染控制后1 - 2周内喉鸣逐渐减轻。