阿莫西林可能会引起一些副作用。一般来说，约5% - 10%的人使用阿莫西林可能出现胃肠道反应，比如恶心、呕吐、腹泻等。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 部分人服用阿莫西林后，会感觉胃部不适，出现恶心的情况，严重些的可能会发生呕吐。比如有的患者在服用阿莫西林后不久，就会觉得肚子里往上反，有要吐的感觉。腹泻： 还有些人会出现腹泻症状，每天可能会有几次稀便。这是因为阿莫西林可能会影响肠道正常的菌群平衡，从而导致肠道功能紊乱引发腹泻。
过敏相关的副作用
皮肤过敏表现： 可能会出现皮疹，皮肤瘙痒等情况。轻者可能是皮肤上出现一些小红点，像针尖大小或者稍大一些的皮疹，伴有瘙痒感；重者可能皮疹范围比较大，瘙痒剧烈。比如有的患者服用阿莫西林后，全身皮肤起了很多红色的斑丘疹，奇痒难耐。严重过敏反应： 极少数人可能会出现严重的过敏反应，如过敏性休克。这种情况非常危急，会出现呼吸困难、面色苍白、血压下降等症状，如果不及时抢救可能会有生命危险。
血液系统相关副作用
白细胞减少： 长期或大剂量使用阿莫西林可能会影响血液系统，导致白细胞数量减少。白细胞是人体免疫系统的重要组成部分，白细胞减少后，人体的抵抗力会下降，更容易受到病原体的侵袭，可能会经常生病。血小板减少： 也有少数人服用阿莫西林后会出现血小板减少的情况，血小板减少会导致凝血功能出现问题，表现为皮肤容易出现瘀斑、瘀点，或者鼻腔、牙龈容易出血等。