一般来说，在医生的严格把控下，使用蓝光烤疗新生儿黄疸是相对安全的，副作用较少，但也可能出现一些不良反应，具体如下：
1.发热：这是最常见的副作用，可能是由于蓝光治疗时，新生儿体温调节中枢不稳定，以及水分丢失等原因引起。
2.腹泻：可能与胆红素经肠道排泄有关。
3.皮疹：可能与胆红素的光毒性反应有关。
4.青铜症：如果胆红素水平过高，或者光疗时间过长，可能会导致皮肤青铜色改变。
5.眼部损伤：如果没有做好防护，可能会损伤视网膜。
需要注意的是，这些副作用大多是暂时的，停止光疗后会逐渐缓解。在光疗过程中，医生会密切监测新生儿的生命体征和胆红素水平，及时发现和处理可能出现的问题。如果家长发现新生儿有任何异常情况，应及时告知医生。