一般来说，同房三天后来月经了，是不会怀孕的。
怀孕的一个重要特征就是停经，如果同房后月经正常来潮，就说明没有怀孕。这是因为怀孕后，女性体内的激素水平会发生变化，从而抑制卵巢排卵，子宫内膜也不会再脱落，也就不会来月经。
需要注意的是，虽然同房三天后来月经了可以排除怀孕的可能，但并不能保证以后不会怀孕。如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等，以避免意外怀孕。
此外，如果出现月经量过少、月经周期紊乱等异常情况，也需要及时就医，排除其他潜在的健康问题。
对于一些特殊人群，如青春期少女、更年期妇女等，由于体内激素水平的变化，月经可能会不太规律，因此需要更加注意避孕和身体健康。如果对月经情况有任何疑问或担忧，建议及时咨询医生。
总之，同房三天后来月经了，一般可以排除怀孕的可能，但如果出现异常情况，应及时就医。同时，建议采取有效的避孕措施，保护自己的身体健康。