全麻手术一般较少出现严重且长期的后遗症，但部分人群可能在术后短时间内出现一些不适，如术后短期的恶心呕吐、头痛等，多数会随时间逐渐缓解。
一、术后短期认知功能影响
部分患者术后短期内可能有记忆力、注意力轻度下降的情况，研究显示一般持续数天至数周，多与麻醉药物在体内代谢及个体对药物的敏感差异有关，老年人相对更易出现短暂认知波动。
二、呼吸系统相关影响
全麻后可能出现短时间的呼吸抑制，尤其对于本身有呼吸系统基础疾病的患者，术后可能有呼吸频率、深度改变，一般经医护人员监测处理可恢复，健康人群多能较快恢复正常呼吸状态。
三、神经系统相关轻度不适
少数患者术后可能有轻微的头晕，这与麻醉药物作用尚未完全消退以及个体神经调节恢复过程有关，通常会在数小时至1 - 2天内逐渐减轻。
四、特殊人群需关注
对于儿童患者，全麻后需特别关注其神经系统发育影响情况，虽大规模研究显示常规剂量短时间全麻一般不显著影响正常发育，但仍需医护人员密切观察术后反应；老年患者全麻后恢复相对缓慢，需更细致的术后监测和护理，以促进身体各系统功能尽快恢复。