巧克力囊肿会导致不孕。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，可引起盆腔粘连、输卵管堵塞等，从而影响受孕。此外，巧克力囊肿还可能导致以下问题，增加不孕的风险。
1.排卵障碍：巧克力囊肿可能影响卵巢功能，导致排卵异常或不排卵。
2.子宫内膜异位症：巧克力囊肿可导致子宫内膜异位到其他部位，如盆腔、输卵管等，影响受精卵的着床和发育。
3.免疫因素：巧克力囊肿可能导致免疫异常，影响精子和卵子的结合及受精卵的着床。
需要注意的是，巧克力囊肿导致不孕的程度因人而异。对于有生育需求的巧克力囊肿患者，应及时就医，评估病情，并采取相应的治疗措施，如手术治疗、药物治疗等，以提高受孕机会。同时，在治疗过程中，患者应注意生活方式的调整，保持良好的心态，积极配合医生的治疗。
此外，对于巧克力囊肿患者，即使已经怀孕，也应密切关注孕期情况，定期进行产前检查，以确保母婴安全。如果在备孕过程中遇到困难，建议及时咨询专业医生，寻求个性化的治疗建议。