喉咙疱疹主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒A组，大约有超过20种血清型的柯萨奇病毒能引发喉咙疱疹相关疾病。
病毒感染因素
柯萨奇病毒引发： 柯萨奇病毒是导致喉咙疱疹比较常见的病原体。这种病毒具有一定的传染性，会通过飞沫传播或者接触被污染的物品等方式进入人体，从而在口腔等部位引发疱疹反应。比如在幼儿园等人员密集场所，儿童之间就容易通过密切接触传播柯萨奇病毒，进而出现喉咙疱疹的情况。单纯疱疹病毒作祟： 单纯疱疹病毒也可能导致喉咙疱疹。单纯疱疹病毒分为Ⅰ型和Ⅱ型，Ⅰ型单纯疱疹病毒就常常会引起口腔部位的疱疹，包括喉咙部位。当人体抵抗力下降时，潜伏在体内的单纯疱疹病毒就可能被激活，导致喉咙出现疱疹症状。
自身免疫力因素
儿童免疫力较低易发病： 儿童的免疫系统还处于发育阶段，相对比较薄弱，对病毒的抵御能力较差。所以儿童患喉咙疱疹的几率相对较高。例如，3 - 10岁的儿童是喉咙疱疹的高发人群，因为这个年龄段孩子的免疫系统尚未完全成熟，更容易受到病毒的侵袭而引发喉咙疱疹。成年人免疫力下降时也会中招： 成年人如果过度劳累、长期睡眠不足、营养不良等，会使自身免疫力下降，此时也容易感染引发喉咙疱疹的病毒。比如一些经常熬夜加班的上班族，身体长期处于疲劳状态，免疫力降低，就可能感染病毒出现喉咙疱疹的症状。
环境因素影响
卫生条件差易滋生病毒： 生活在卫生条件较差的环境中，比如居住环境脏乱、公共卫生设施不完善等，会增加感染病毒的风险。因为这样的环境有利于病毒的滋生和传播，人们接触到病毒的机会就会增多，从而容易引发喉咙疱疹。例如在一些卫生条件落后的偏远地区，喉咙疱疹的发病率可能相对较高。季节变化带来影响： 季节交替的时候，气温变化较大，人体容易出现不适，免疫力也可能受到一定影响。像在春夏之交或者秋冬之交，喉咙疱疹的发病率会有所上升。这是因为季节变化导致人体的生理机能需要适应新的环境，此时病毒更容易侵袭人体引发喉咙疱疹。