手臂囊肿是否会自己消失不能一概而论，一般较小的生理性囊肿有一定概率自己消失，但多数情况需干预。比如一些因轻微外伤导致的局部组织液渗出形成的较小囊肿，有可能在数周内自行吸收消退。
囊肿的类型差异
腱鞘囊肿：
良性小囊肿： 多见于手腕背侧、掌侧或足背部。较小的腱鞘囊肿有自行消退的可能，尤其是那些因局部过度使用、轻微损伤后形成的。但也有很多腱鞘囊肿会持续存在甚至逐渐增大。较大或持续囊肿： 如果腱鞘囊肿较大，压迫周围组织引起疼痛、麻木等症状，或者长时间不消退，一般不会自己消失，需要进行治疗，如穿刺抽液、注射药物或手术切除等。
皮脂腺囊肿：
一般难自行消失： 是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。它通常不会自行消失，而且还有继发感染的可能，一旦继发感染会出现红肿、疼痛、化脓等症状，需要进行抗感染治疗甚至手术切除。
表皮样囊肿：
难以自行消退： 多因外伤致表皮植入皮下生长形成。这类囊肿一般不会自己消失，若不处理，可能会逐渐增大，还可能引发局部炎症反应等问题，通常需要手术切除来解决。