新生儿做CT检查的危害主要包括以下几个方面：
1.辐射危害：CT检查是利用X线束对人体进行断层扫描，从而获得影像学结果。X射线对人体有一定的辐射作用，虽然单次检查的辐射剂量较低，但对于新生儿的生长发育仍可能产生潜在影响，如增加患癌症的风险。
2.对比剂危害：在某些情况下，医生可能会在CT检查前给新生儿注射对比剂，以提高检查的清晰度。对比剂可能会引起过敏反应或其他不良反应，如呼吸困难、皮肤瘙痒等。
3.镇静剂危害：对于不配合检查的新生儿，医生可能会使用镇静剂来使其安静。镇静剂可能会对新生儿的呼吸、心跳等生理功能产生一定影响，需要在专业医生的监护下使用。
4.图像质量：新生儿的身体结构和生理功能尚未完全发育成熟，CT检查的图像质量可能受到一定影响，导致医生难以准确评估病情。
需要注意的是，虽然CT检查可能存在一定的危害，但在某些情况下，如怀疑新生儿存在脑部疾病、严重外伤等情况时，医生会根据具体情况权衡利弊，选择最合适的检查方法。在进行CT检查前，医生会详细告知家长检查的风险和益处，并在检查过程中尽可能减少辐射剂量和对比剂的使用。家长也可以与医生充分沟通，了解更多关于检查的细节和注意事项。如果对新生儿的健康有任何疑虑，建议及时咨询专业医生的意见。