宫颈癌疫苗二价和四价主要区别在于预防病毒亚型和适用年龄不同。二价疫苗一般价格在300~600元/针左右，全程需接种3针，总共价格约900~1800元；四价疫苗价格大概在600~800元/针，全程3针，总费用约1800~2400元。
预防病毒亚型：
二价宫颈癌疫苗：主要针对高危型HPV16和HPV18亚型，这两种亚型引发宫颈癌的风险较高，约70%的宫颈癌由它们导致。四价宫颈癌疫苗：预防的病毒亚型更多，除了HPV16和HPV18外，还包括HPV6和HPV11。其中HPV6和HPV11虽不属于高危型，但能引起90%的尖锐湿疣。
适用年龄：
二价宫颈癌疫苗：适合9~45岁的女性接种。四价宫颈癌疫苗：适用年龄是20~45岁的女性。
接种程序：
二价宫颈癌疫苗：接种程序为0、1、6个月各接种1剂，也就是第一针打完后，1个月打第二针，6个月打第三针。四价宫颈癌疫苗：接种程序同样是0、2、6个月各接种1剂，即第一针打完，隔2个月打第二针，隔6个月打第三针。
接种注意事项：
二价宫颈癌疫苗：对蛋白质过敏者要谨慎接种。处于发热、怀孕阶段的女性不建议接种，等身体恢复或分娩结束后再考虑接种。四价宫颈癌疫苗：对疫苗成分过敏者不能接种。有严重过敏史的人也要避免接种。正在发热、备孕或者已经怀孕的女性同样不适合接种，哺乳期女性接种需咨询医生。