宝宝做脑部CT的副作用主要与辐射有关，一般单次脑部CT检查的辐射剂量相对较低，但仍需谨慎。单次小儿脑部CT的辐射剂量通常在0.02~0.1mSv左右，不过频繁多次检查可能会累积辐射风险。
辐射暴露风险
短期影响： 单次脑部CT的辐射剂量相对可控，但多次或频繁进行脑部CT检查，可能会增加儿童患癌症的潜在风险。虽然单次检查辐射暴露导致癌症发生的概率较低，但累积剂量越高，风险相对增加。长期影响： 对于儿童正在发育的身体来说，辐射可能对细胞分裂等产生一定影响，不过这种影响在单次合理检查下一般较轻微，但需要避免不必要的重复检查。
对比剂相关风险（若使用）
过敏反应： 如果在脑部CT检查中使用了含碘对比剂，宝宝可能出现过敏反应。轻度过敏可能表现为皮疹、瘙痒等，重度过敏可能出现呼吸困难、过敏性休克等。一般在检查前会进行过敏史询问和评估，但仍有小概率发生过敏情况。肾功能影响： 含碘对比剂需要通过肾脏排泄，对于肾功能尚未发育完全的宝宝，可能会加重肾脏负担。不过现在使用的对比剂多为低渗或等渗对比剂，相对安全性有所提高，但仍需关注宝宝肾功能情况。
检查过程中的不适
固定体位困难： 宝宝在做脑部CT时需要保持固定体位，年龄较小的宝宝可能难以配合，需要家长协助固定，这可能会让宝宝感到不适甚至哭闹。噪声影响： CT检查时会有较大的噪声，宝宝可能会因为噪声感到惊吓，产生恐惧心理，不过检查时间较短，一般影响相对有限。