一、饮食因素相关
晚餐进食不当：若晚餐进食过多、过快，或食用了过多辛辣、油腻、刺激性食物，如大量辣椒、油炸食品等，会加重胃肠消化负担，导致半夜胃不舒服。例如，进食辛辣食物后，辣椒素会刺激胃黏膜，引起胃部不适。而且，高脂食物不易消化，在胃内停留时间较长，也可能引发半夜胃部的不适感。不同年龄人群对此的耐受程度不同，儿童消化系统发育尚不完善，更易因晚餐不当出现半夜胃不舒服；老年人胃肠功能减退，也较易受饮食影响。
空腹或过饱状态：空腹时胃内胃酸分泌相对较多，若胃酸过多，可能刺激胃黏膜引发不适；而过饱状态下胃处于扩张状态，夜间平躺时可能会出现反流等情况导致胃不舒服。不同生活方式的人，如长期熬夜、饮食不规律的人群，更易出现空腹或过饱后半夜胃不舒服的情况；有胃溃疡等病史的人，本身胃黏膜存在损伤，饮食因素导致半夜胃不舒服的风险更高。
二、胃部疾病相关
胃溃疡：胃溃疡患者的疼痛具有节律性，多在进食后一段时间出现，然后缓解，部分患者可能会在半夜出现疼痛不适。这是因为夜间胃酸分泌相对增多，而溃疡面受到胃酸刺激所致。不同年龄的胃溃疡患者表现可能有差异，儿童胃溃疡相对少见，但一旦发生，半夜胃不舒服的表现可能较为隐匿；老年胃溃疡患者可能症状不典型，更易被忽视。有胃溃疡病史的人，若近期饮食、生活习惯改变，或未规范治疗，更容易在半夜出现胃不舒服。
十二指肠溃疡：十二指肠溃疡的疼痛特点常为空腹痛，即空腹时疼痛明显，多在进食后缓解，所以患者常常会在半夜出现胃部疼痛不适。这是由于空腹时胃酸进入十二指肠，刺激溃疡面引起疼痛。不同性别在十二指肠溃疡的发病上可能有一定差异，男性相对发病率可能略高一些。有十二指肠溃疡病史者，若不注意饮食和生活规律，半夜胃不舒服的概率增加。
胃炎：各种类型的胃炎，如慢性非萎缩性胃炎、萎缩性胃炎等，胃黏膜存在不同程度的炎症病变，夜间胃蠕动相对缓慢，炎症部位受各种因素刺激可能导致半夜胃不舒服。比如慢性非萎缩性胃炎患者，胃黏膜有充血、水肿等情况，半夜可能因胃酸等因素刺激出现不适；萎缩性胃炎患者胃黏膜腺体萎缩，消化功能减退，也易在半夜出现胃部不适。不同生活方式的胃炎患者，如长期吸烟、饮酒者，病情更容易反复，半夜胃不舒服的可能性更大；有胃炎病史且合并幽门螺杆菌感染的人，半夜胃不舒服的概率也会升高。
三、其他因素相关
精神心理因素：长期精神紧张、焦虑、压力过大等精神心理因素可能影响胃肠功能，导致半夜胃不舒服。例如，长期处于高压工作状态的人群，精神紧张会通过神经内分泌调节影响胃肠道，出现胃部不适。不同年龄人群受精神心理因素影响的程度不同，青少年可能因学习压力等出现精神心理因素相关的半夜胃不舒服；老年人若有生活事件刺激，也易因精神心理因素导致胃部不适。有精神心理疾病病史或长期精神状态不佳的人，半夜胃不舒服的风险更高。
体位因素：睡眠时体位改变，如从站立位变为平卧位，对于一些有胃食管反流倾向的人来说，容易导致胃酸反流至食管，刺激食管及胃部，引起半夜胃不舒服。比如肥胖人群，由于腹部脂肪堆积，更容易出现胃食管反流相关的半夜胃部不适；老年人食管下括约肌功能减退，也较易因体位改变出现胃酸反流导致的半夜胃不舒服。