阑尾黏液囊肿患者的生存时间不能一概而论，早期发现并规范治疗的话，多数患者可以长期生存，甚至不影响自然寿命。
疾病的病理特征影响预后
阑尾黏液囊肿是阑尾的良性病变，但存在恶变可能。如果能在病变早期就被发现，通过手术完整切除囊肿，预后通常较好，对生存时间影响较小。但如果囊肿发生恶变，发展为阑尾黏液腺癌等恶性肿瘤，预后则会变差，不过具体生存时间也因个体差异以及病情严重程度等不同而有很大差异。一般来说，早期阑尾黏液腺癌患者经过规范治疗，5年生存率可能在50%~70%左右，但晚期患者预后则明显不佳。
治疗方式对生存的作用
手术是治疗阑尾黏液囊肿的主要手段。如果是单纯的阑尾黏液囊肿，通过手术完整切除阑尾及囊肿，患者恢复良好，生存时间基本不受影响，和正常人一样可以正常生活、工作，寿命不受该病明显影响。而对于已经恶变的情况，除了手术，可能还需要结合化疗等综合治疗，治疗效果好的患者生存时间会相对长些，治疗效果差的则生存时间会缩短。
患者自身状况的影响
患者的身体基础状况也很关键。如果患者本身身体状况良好，没有其他严重基础疾病，那么在面对阑尾黏液囊肿相关治疗时，身体的耐受性较好，术后恢复等情况相对更理想，对生存时间的负面影响较小。反之，如果患者本身有心脏病、糖尿病等严重基础疾病，那么在治疗过程中可能会面临更多风险，也会影响生存时间。例如，本身有严重糖尿病的患者，术后伤口愈合可能会受到影响，增加感染等并发症风险，从而间接影响生存情况。