小肚子疼可能由多种原因引起。比如女性生理期时，约60% - 90%的女性会有不同程度的小肚子疼，一般月经来潮后疼痛会逐渐缓解。
一、消化系统问题导致的小肚子疼
肠道痉挛： 多因饮食不当引起，比如吃了过多生冷食物。表现为突然发作的阵发性小肚子疼，疼痛程度轻重不一，可能持续几分钟到几十分钟不等。肠炎： 细菌、病毒感染肠道可引发肠炎导致小肚子疼。细菌性肠炎可能是食用了被污染的食物，除了小肚子疼，还可能伴有腹泻，每天腹泻次数可能在数次到十余次不等，大便可能呈稀水样或黏液脓血便；病毒性肠炎常见于轮状病毒感染，好发于婴幼儿，除小肚子疼、腹泻外，可能伴有呕吐症状。
二、妇科问题引发的小肚子疼
痛经： 分为原发性痛经和继发性痛经。原发性痛经多见于未婚未育女性，主要是月经期间子宫内膜前列腺素含量增高引起，疼痛多在月经来潮后开始，最早可在经前12小时出现，以行经第1日疼痛最剧烈，持续2 - 3日后缓解，疼痛部位多在下腹部耻骨上，可放射至腰骶部和大腿内侧。继发性痛经多见于有盆腔器质性疾病者，如子宫内膜异位症、子宫腺肌病等，疼痛时间可能不限于经期，会逐渐加重。盆腔炎： 女性上生殖道感染引起的一组疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎等。患者会有下腹部疼痛，疼痛程度不一，可为持续性，活动或性交后加重，还可能伴有阴道分泌物增多、异常阴道流血等症状，若病情严重，可能出现发热甚至高热、寒战等全身症状。
三、泌尿系统问题造成的小肚子疼
输尿管结石： 结石在输尿管内移动时会引起小肚子疼，疼痛多为突然发作的绞痛，疼痛程度较为剧烈，可向会阴部放射，同时可能伴有血尿，血尿可为镜下血尿，也可为肉眼血尿，部分患者还可能出现恶心、呕吐等症状。膀胱炎： 多由细菌感染引起，主要表现为小肚子疼，疼痛部位多在耻骨上区，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，排尿终末时疼痛可能加重，部分患者尿液可浑浊。