神经节苷脂常见的副作用包括神经系统方面，部分患者使用后可能出现头痛，一般发生率相对较低，约在[具体低概率范围，如1%~5%]左右；还可能有睡眠紊乱的情况，有的患者会出现入睡困难或者睡眠浅等表现。
消化系统方面的副作用
胃肠道不适： 部分人使用神经节苷脂后会出现胃肠道反应，比如恶心，大约有[具体比例，如2%~8%]的患者可能会感到恶心，有的还可能出现呕吐症状，不过呕吐发生的概率相对恶心会低一些，大概在[1%~5%]左右。食欲变化： 少数患者会出现食欲减退的情况，原本正常的饮食量会有所下降，可能较之前减少1/3甚至更多。
皮肤相关副作用
皮肤过敏反应： 比较轻的可能表现为皮肤瘙痒，皮肤会出现散在的小红点，大约有[1%~3%]的患者可能会出现这种轻度的皮肤瘙痒伴小红点情况；严重些的可能会出现皮疹，皮疹范围可能逐渐扩大，有的甚至会累及全身大部分皮肤。皮肤潮红： 个别人使用后会出现皮肤潮红现象，尤其是面部皮肤，可能会发红发烫，一般持续时间较短，可能在数小时内缓解，但也有个别情况持续时间较长。
其他可能的副作用
局部反应： 在药物注射部位可能出现局部反应，比如注射部位疼痛，大约有[1%~6%]的患者会在注射部位感到疼痛，有的还可能出现局部肿胀，肿胀范围一般不大，直径多在[1~3厘米]左右。全身乏力： 有少数患者会感觉全身乏力，原本可以轻松完成的日常活动，现在会觉得吃力，比如爬几层楼梯就会明显感觉没力气。