新生儿吃母乳时肚子咕噜咕噜响，可能是正常的肠鸣音，也可能是消化不良、乳糖不耐受等原因引起的。具体分析如下：
1.正常肠鸣音：新生儿的肠道功能尚未完全发育，吃奶时可能会吞咽下较多的空气，同时吸吮动作也会刺激肠道蠕动，从而产生肠鸣音，这是正常的生理现象，通常不需要特殊处理。
2.消化不良：如果新生儿的母亲吃了过多油腻、生冷的食物，可能会通过母乳影响新生儿，导致其消化不良，引起肠鸣音亢进、腹胀、腹泻等症状。此时，母亲应注意调整饮食，避免食用上述食物，同时可以给新生儿服用益生菌，调节肠道菌群，帮助消化。
3.乳糖不耐受：如果新生儿体内缺乏乳糖酶，无法完全消化母乳或牛奶中的乳糖，就可能会导致乳糖不耐受，引起肠鸣音亢进、腹泻等症状。此时，母亲可以在医生的指导下，给新生儿添加乳糖酶或改喂无乳糖配方奶。
需要注意的是，如果新生儿除了肚子咕噜咕噜响外，还伴有哭闹、呕吐、腹泻、发热等症状，或者肠鸣音过于亢进或持续时间过长，建议及时就医，以便明确原因，并采取相应的治疗措施。