肾结石的形成与多种因素相关。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超过了其在尿液中的溶解度，就容易析出形成结石。比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分异常增多时，就可能引发肾结石。
代谢异常因素
尿液成分改变： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质含量过高时，就容易形成结石。例如，尿钙排泄增多，会使尿液中钙的浓度升高，增加肾结石形成风险；草酸摄入过多，比如长期大量吃菠菜、甜菜等富含草酸的食物，会导致尿草酸水平升高，进而促进草酸钙结石形成。尿量减少： 人体每天需要保证足够的尿量来稀释尿液中的成石物质。如果尿量少于1500毫升/天，尿液中结石物质的浓度就会升高，容易析出形成结石。像一些出汗多、饮水少的人，就更容易出现尿量减少的情况，增加肾结石发生几率。
局部因素
尿路梗阻： 尿路存在梗阻时，尿液排出不畅，会导致尿液在局部潴留，使尿液中的晶体物质更容易沉积下来形成结石。比如肾盂输尿管连接部狭窄、输尿管结石等都可能引起尿路梗阻，从而诱发肾结石。尿路感染： 泌尿系统发生感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使晶体物质围绕其沉积形成结石。而且感染还会改变尿液的酸碱度，影响结石的形成和生长。
其他因素
饮食因素： 除了草酸摄入过多外，高嘌呤饮食也会增加肾结石风险。比如长期大量吃动物内脏、海鲜等富含嘌呤的食物，会使尿酸生成增多，容易形成尿酸结石。另外，摄入过多高蛋白、高盐食物也可能对肾结石形成有影响。药物因素： 某些药物也可能导致肾结石形成。例如，长期服用维生素C，在体内代谢后会使尿草酸排泄增加；长期服用氨苯蝶啶等药物，也可能增加肾结石的发生几率。地理环境和气候因素： 不同地区的地理环境和气候条件对肾结石的形成也有一定影响。比如在炎热地区，人体出汗多，尿量减少，尿液中结石物质浓度升高，容易诱发肾结石；而在一些水质较硬的地区，水中钙等矿物质含量较高，也可能增加肾结石发生的可能性。