做核磁共振一般不会有明显疼痛。通常检查过程中患者基本感觉不到痛苦，整个检查过程大概10 - 30分钟左右。
检查环境与设备特点
检查环境： 核磁共振检查室相对封闭，但环境舒适。检查床是可移动的，能平稳地将患者送入检查孔内。设备的磁场是逐渐开启的，患者在进入检查状态时不会有突然的不适感觉。设备特点： 核磁共振仪的扫描孔虽然有一定的空间限制，但一般成年人都能比较舒适地躺入。仪器运行时产生的噪音在可接受范围内，通常在60 - 85分贝左右，不过检查时会给患者佩戴耳塞来降低噪音影响。
不同检查部位的感受差异
头部检查： 头部检查时，患者只需要安静躺在检查床上，将头部放入线圈内。一般来说，头部检查过程中患者基本没有疼痛感觉，只需要保持头部不动即可，整个过程比较平稳。腹部检查： 腹部检查时，患者需要放松腹部。在检查过程中，可能会因为腹部需要保持静止而有少许的紧绷感，但不会有疼痛。如果患者腹部有手术疤痕等情况，可能会有一些特殊的感受，但也不会是疼痛。四肢检查： 四肢检查相对简单，将需要检查的肢体放置在合适的位置即可。检查过程中患者几乎感觉不到疼痛，主要是要配合医生保持肢体不动，以保证图像的清晰。
特殊人群的检查情况
儿童患者： 对于儿童患者，可能需要在检查前适当安抚。如果儿童比较小，可能需要使用镇静剂来帮助其配合检查。但在检查过程中，一般也不会有疼痛，不过家长需要在检查前向医生充分告知儿童的健康状况等信息，以便医生做好相应准备。紧张焦虑患者： 对于本身比较紧张焦虑的患者，在检查前医生会进行沟通安抚。在检查过程中，医生也会随时关注患者的状态，紧张焦虑的情绪可能会让患者感觉稍微不舒适，但这不是因为检查本身带来疼痛，通过医生的安抚大多可以缓解。