一、神经系统疾病
1.脑部肿瘤：核磁共振可清晰显示肿瘤的位置、大小、形态及与周围组织的关系，有助于肿瘤的早期诊断与分期。例如胶质瘤、脑膜瘤等，其软组织分辨力高，能发现微小病灶。
2.脑血管疾病：如脑梗死，在发病数小时后核磁共振的弥散加权成像（DWI）即可显示高信号，有助于早期诊断与治疗；还能检测脑出血，判断出血时间等。另外，对脑动脉瘤、脑血管畸形等血管病变的诊断也有重要价值。
3.神经系统退行性病变：像阿尔茨海默病，核磁共振可观察到大脑特定区域如海马体的萎缩情况，辅助早期诊断与病情监测；帕金森病也可通过核磁共振查看脑内黑质等结构的变化。
4.脱髓鞘疾病：如多发性硬化，核磁共振能发现脑白质内多发的脱髓鞘病灶，对疾病的诊断、病情评估及治疗监测有重要意义。
二、头颈部疾病
1.眼部疾病：如视网膜脱离、眼内肿瘤等，能清晰显示眼部各组织结构，帮助明确病变位置与范围。
2.耳部疾病：可诊断内耳畸形、听神经瘤等，对耳部疾病的定位与定性诊断有很大帮助。
3.鼻窦与鼻咽部疾病：鼻窦炎、鼻息肉、鼻咽癌等，可清晰显示病变累及范围及周围骨质破坏情况。
三、胸部疾病
1.肺部疾病：对肺内肿瘤，尤其是纵膈旁、胸膜下等部位的肿瘤，核磁共振能更好地显示其与周围组织的关系；对于肺部炎症、肺不张等也有一定诊断价值。
2.纵膈疾病：如纵膈肿瘤，可准确判断肿瘤的位置、大小、形态及与周围血管、气管等结构的关系，为手术方案制定提供重要依据。
四、腹部疾病
1.肝脏疾病：肝癌、肝血管瘤、肝囊肿等肝脏病变，核磁共振可多序列成像，清晰显示病变特征，有助于鉴别诊断；对肝硬化的诊断及肝脏纤维化程度评估也有一定作用。
2.胆囊与胰腺疾病：胆囊炎、胆结石、胆囊癌，以及胰腺炎、胰腺癌等，可显示病变形态、大小及周围侵犯情况。
3.肾脏疾病：肾癌、肾囊肿、肾盂癌等，能清晰显示肾脏病变，对肾脏先天性畸形的诊断也很有帮助。
五、盆腔疾病
1.女性盆腔疾病：子宫肌瘤、子宫腺肌病、子宫内膜癌、卵巢肿瘤等，可清晰显示病变位置、大小、形态，对疾病分期有重要意义；还能观察盆腔内其他结构如输卵管等情况。
2.男性盆腔疾病：前列腺增生、前列腺癌等，核磁共振能较好地显示前列腺病变，帮助判断病情。
六、脊柱与脊髓疾病
1.脊柱病变：椎体骨折、脊柱结核、脊柱肿瘤等，可清晰显示椎体骨质破坏、椎间隙变化及周围软组织情况；对脊柱退行性变如椎间盘突出、椎管狭窄等的诊断也很准确，能明确突出部位、程度及对脊髓和神经根的压迫情况。
2.脊髓病变：脊髓炎、脊髓肿瘤等，可显示脊髓形态、信号改变，帮助定位与定性诊断。
七、骨骼肌肉系统疾病
1.骨肿瘤：原发性骨肿瘤如骨肉瘤、骨巨细胞瘤，以及骨转移瘤等，核磁共振能早期发现病变，并清晰显示肿瘤在骨髓腔内的侵犯范围及周围软组织肿块情况。
2.关节疾病：如膝关节半月板损伤、交叉韧带损伤，肩关节肩袖损伤等，可清晰显示关节软骨、韧带、半月板等结构的病变，为关节疾病的诊断与治疗提供重要依据；对类风湿关节炎、痛风性关节炎等关节炎性疾病，也能显示关节滑膜增厚、骨质破坏等情况。
特殊人群提示：
1.孕妇：虽然核磁共振通常不使用电离辐射，相对较为安全，但在孕早期（前3个月），由于胎儿处于器官形成的关键时期，除非有明确的临床必需，一般不建议进行核磁共振检查。孕中晚期如需检查，需在医生充分评估病情利弊后进行。这是因为虽然目前尚无确凿证据表明核磁共振对胎儿有不良影响，但谨慎起见，要优先考虑胎儿的安全。
2.儿童：儿童在进行核磁共振检查时，由于检查时间相对较长，且机器噪音较大，可能会产生恐惧、不配合的情况。此时，家长应提前做好安抚工作，必要时可在医生指导下适当使用镇静剂，以确保检查顺利进行。同时，要注意保护儿童的听力，可佩戴耳塞等防护用品。
3.老年人：老年人常合并多种基础疾病，如心肺功能不全等。在进行核磁共振检查前，医生需详细评估老人的身体状况，确保其能耐受检查。对于体内有金属植入物（如心脏起搏器、金属假牙等）的老人，部分情况下可能无法进行核磁共振检查，需提前告知医生相关情况，以便选择合适的检查方法。