临床常用的抗真菌药物主要有以下几类：
1.多烯类抗真菌药：代表药物有两性霉素B及其含脂制剂。这一类药物对深部真菌有强大的抑制作用，是治疗深部真菌感染的首选药物。两性霉素B对细菌、原虫及病毒也有抑制作用，不良反应较多，可有寒战、高热、头痛、呕吐等。
2.唑类抗真菌药：包括咪唑类和三唑类。咪唑类药物有酮康唑、咪康唑、克霉唑等；三唑类药物有氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑等。这类药物的抗菌谱较广，对深部和浅表的真菌均有抗菌作用，毒性低，不良反应较两性霉素B少，是目前临床应用最广泛的一类抗真菌药。
3.棘白菌素类抗真菌药：代表药物有卡泊芬净、米卡芬净、阿尼芬净等。这类药物对念珠菌属和曲霉属有抗菌活性，对真菌细胞壁的合成有抑制作用，不良反应较少。
4.其他抗真菌药：如氟胞嘧啶，对念珠菌属有抗菌作用，与两性霉素B联合使用可提高疗效。特比萘芬对皮肤癣菌有抗菌作用，不良反应较少。