发酵苦丁茶具有一定的保健功效。研究表明，适量饮用发酵苦丁茶可能有助于调节血脂，有相关研究发现连续饮用发酵苦丁茶一段时间后，部分人群的血脂指标能得到一定程度的改善。
对心血管的潜在益处
改善血管功能：发酵苦丁茶中含有的某些成分可能对血管有一定的保护作用，能够在一定程度上帮助维持血管的弹性。有研究显示，长期饮用发酵苦丁茶的人群，其血管内皮功能相对较好，有助于血管更好地舒张和收缩。辅助调节血压：有初步研究发现，发酵苦丁茶可能对血压有一定的辅助调节作用。不过需要注意的是，它不能替代正规的降压药物治疗。对于血压处于正常高值或者轻度高血压的人群，适量饮用发酵苦丁茶可能是一种辅助的保健方式，但不能自行停用降压药。
对消化系统的影响
促进消化：发酵苦丁茶可能对消化系统有一定的促进作用，能够在一定程度上帮助改善胃肠道的蠕动功能。比如，部分人饮用后可能会感觉消化更加顺畅，食欲也可能会有所提升。不过，对于本身有严重消化系统疾病的人群，不能单纯依赖发酵苦丁茶来治疗，还是要遵循医生的治疗方案。缓解胃部不适：有一些人反馈，饮用发酵苦丁茶后能够在一定程度上缓解轻度的胃部不适，如胃胀等情况。但如果胃部不适较为严重，还是需要及时就医检查，不能仅仅依靠发酵苦丁茶来解决问题。
对代谢的调节作用
辅助调节血糖：有一些初步的研究迹象表明，发酵苦丁茶可能对血糖有一定的辅助调节作用。对于血糖处于正常高值或者有胰岛素抵抗倾向的人群，适量饮用发酵苦丁茶可能有助于维持血糖的相对稳定。但同样，它不能替代降糖药物治疗糖尿病患者，糖尿病患者还是要严格按照医生的治疗方案进行治疗。帮助控制体重：从一些观察性研究来看，长期饮用发酵苦丁茶可能在一定程度上对体重的控制有辅助作用。因为它可能会在一定程度上影响机体的代谢过程，帮助消耗部分多余的热量，但这也需要结合合理的饮食和运动来共同发挥作用，不能单纯依靠发酵苦丁茶来达到减肥的目的。