睡眠障碍综合征表现多样，常见的有入睡困难、睡眠维持困难、早醒等，还可能伴随白天困倦、注意力不集中、情绪不佳等情况。
入睡困难
入睡时间比正常情况明显延长，有些人躺上床后很久都无法进入睡眠状态，可能长达30分钟以上还难以入眠，这会影响后续的睡眠时长和质量，尤其对于有工作或学习任务的人群，会导致第二天精神状态受影响。
睡眠维持困难
夜间睡眠过程中容易醒来，醒来后再次入睡困难。比如夜间醒来几次，每次醒来后就很难重新睡着，这样的情况会使睡眠处于碎片化状态，身体得不到充分的深度睡眠，长期如此会对身体健康产生不良影响，像免疫力可能会下降等。
早醒
比正常起床时间提前醒来，且醒来后无法再入睡。例如本应7点起床，但5点就醒来，之后就处于清醒状态，这会导致总的睡眠时间不足，影响白天的活动和精神状态，对于儿童可能会影响生长发育，因为生长激素在深度睡眠时分泌较多。
伴随日间症状
白天会出现明显的困倦感，即使夜间看似睡了足够长时间，但还是感觉没休息好，注意力难以集中，工作或学习效率下降。同时，情绪也可能受到影响，容易出现烦躁、焦虑、抑郁等情绪变化，而且不同年龄段人群受影响的表现可能略有不同，比如老年人可能更易出现认知功能轻度下降等情况。