益生菌是一类对宿主有益的活性微生物，定植于人体肠道、生殖系统内，能产生确切健康功效从而改善宿主微生态平衡、发挥有益作用。补充益生菌的最佳时间是饭后，因为有食物中和胃酸，更有利于益生菌活着到达肠道发挥作用。但不同种类的益生菌，服用时间也有一定差异。
嗜酸乳杆菌：最佳服用时间是饭后2小时。嗜酸乳杆菌不耐酸，空腹时胃酸分泌较多，容易杀死嗜酸乳杆菌，饭后胃酸被食物稀释，更有利于嗜酸乳杆菌到达肠道发挥作用。
双歧杆菌：最佳服用时间是饭后30分钟。双歧杆菌也不耐酸，空腹时胃酸分泌较多，容易杀死双歧杆菌，饭后胃酸被食物稀释，更有利于双歧杆菌到达肠道发挥作用。
干酪乳杆菌：最佳服用时间是饭后1小时。干酪乳杆菌耐酸，空腹时胃酸分泌较多，对干酪乳杆菌影响不大，饭后胃酸被食物稀释，更有利于干酪乳杆菌到达肠道发挥作用。
需要注意的是，益生菌虽然对人体有益，但也不能过量服用。过量服用益生菌可能会导致肠道菌群失调，引起腹泻、腹痛等症状。此外，益生菌的效果还受到菌株、剂型、服用方法等因素的影响。在选择益生菌时，应选择适合自己的产品，并按照说明书的要求服用。
特殊人群服用益生菌需要注意以下几点：
胃酸过多的人：胃酸过多的人应在饭后服用益生菌，以免胃酸过多杀死益生菌。
免疫力低下的人：免疫力低下的人可以在医生的指导下服用益生菌，以增强免疫力。
正在服用抗生素的人：正在服用抗生素的人应在服用抗生素后2小时服用益生菌，以免抗生素杀死益生菌。
孕妇和婴幼儿：孕妇和婴幼儿服用益生菌应在医生的指导下进行。