阿莫西林克拉维酸钾可能会引起一些副作用。一般来说，约5%的患者可能会出现胃肠道反应，比如恶心、呕吐、腹泻等。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 部分人服用后可能出现恶心症状，严重的可能会引发呕吐。通常是因为药物刺激胃肠道，影响了胃肠道的正常消化功能导致的。腹泻： 也有患者会出现腹泻情况，轻者可能是大便次数比平时稍有增多，重者可能腹泻较为频繁。这是因为药物改变了肠道内的菌群平衡或者刺激肠道蠕动加快所致。
过敏相关副作用
皮肤过敏表现： 可能出现皮疹，表现为皮肤出现红色的小疙瘩，伴有瘙痒感；还可能出现荨麻疹，皮肤表面出现大小不等的风团样皮疹，瘙痒明显。这是因为人体对阿莫西林克拉维酸钾中的某些成分产生过敏反应，免疫系统被激活后引发皮肤的异常反应。严重过敏反应： 虽然比较少见，但也有可能出现过敏性休克，这是非常危急的情况，会出现呼吸困难、血压急剧下降、意识丧失等症状，需要立即进行抢救。
对血液系统的影响
血常规变化： 个别患者可能会出现血常规异常，比如白细胞减少、血小板减少等。白细胞减少会使人体抵抗力下降，容易受到病原体的侵袭；血小板减少可能会导致出血倾向，如皮肤出现瘀点、瘀斑，鼻出血、牙龈出血等情况。不过这种血液系统的副作用发生概率相对较低。
对肝脏的潜在影响
肝功能指标异常： 少数患者在服用阿莫西林克拉维酸钾后，可能会引起肝功能指标的改变，如转氨酶升高等。这是因为药物需要经过肝脏代谢，可能会对肝脏细胞产生一定的影响，但一般在停药后大多可以恢复正常。