一侧后脑勺疼痛的原因，可能是紧张型头痛或者枕神经痛。紧张型头痛的性质主要是轻中度的钝痛或者胀痛，人往往会有头部的紧箍、压迫或者沉重感，很多病人还会合并有焦虑、抑郁、失眠。
紧张性头痛的头痛程度不严重，出现呕吐的很少，有少部分人可能会出现恶心、畏光、畏声这些症状。在检查的时候可以在病人后枕部肌肉做按压，看看有没有压痛，如果有压痛，也提示可能是紧张型头痛。
枕神经痛也容易发生在后脑勺的位置，因为枕神经分枕大、枕小和耳大三个分支，枕大和枕小都分布在后脑勺的位置，疼痛的性质常常是发作性，表现为电击样、抽搐样或者针刺样的疼痛，病人可能会告诉隔几秒痛一下，痛起来非常难受。
一些活动也会加重疼痛的发作，比如咳嗽或者活动颈部会加重疼痛。