儿童肌酸激酶同工酶偏高可能是生理因素引起，也可能是疾病导致。针对不同原因，处理方法有所不同，具体如下：
1.生理因素：儿童剧烈运动、过度劳累、发热等情况下，可能导致肌酸激酶同工酶偏高。这种情况通常不需要特殊处理，去除诱因后，酶学指标可自行恢复正常。
2.疾病因素：
心肌损伤：如病毒性心肌炎、扩张型心肌病、肥厚型心肌病等，都可能导致心肌细胞受损，从而使肌酸激酶同工酶释放入血，升高明显。需要及时就医，遵医嘱进行营养心肌、抗病毒或手术治疗等。
肌肉损伤：剧烈运动、肌肉注射、外伤等可导致肌肉损伤，从而使肌酸激酶同工酶偏高。一般无需特殊治疗，适当休息后可逐渐恢复正常。
其他：营养不良、肝炎、肺炎等也可能导致肌酸激酶同工酶偏高。需要针对原发病进行治疗，如补充营养、保肝治疗、抗感染治疗等。
需要注意的是，肌酸激酶同工酶偏高的原因较为复杂，处理方法也因病因而异。如果发现儿童肌酸激酶同工酶偏高，建议及时就医，完善相关检查，如心电图、心脏超声、心肌酶谱等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意观察儿童的症状，如有无胸痛、胸闷、呼吸困难、乏力等，如有异常，应及时就医。