面瘫埋线治疗可能出现一些副作用，比如局部感染风险，有研究显示，约3% - 5%接受埋线治疗的面瘫患者可能出现局部轻微红肿、疼痛，若护理不当，感染概率会升高。
局部组织反应方面
局部红肿疼痛： 埋线操作会对局部组织造成一定损伤，部分患者在埋线后的1 - 3天内可能出现局部红肿，一般程度较轻，多数可在1周内自行缓解。但也有少数患者红肿疼痛较为明显，持续时间较长。局部淤血： 埋线时可能损伤小血管，导致局部淤血，表现为皮肤青紫，一般1 - 2周可逐渐消退，不过也有个别患者淤血消退时间会延长至3周左右。
全身方面的可能反应
过敏反应： 虽然相对少见，但仍有发生过敏的可能。如果患者对埋线所用的材料等过敏，可能出现全身瘙痒、皮疹，严重时甚至会出现呼吸困难等过敏症状。不过这种过敏反应的发生率非常低，大约在0.1%以下。发热： 极少数患者在埋线后可能出现低热，体温一般在37.5℃ - 38℃之间，通常持续1 - 2天可自行恢复正常。但如果发热持续时间超过3天或体温超过38.5℃，就需要及时就医排查原因。
对治疗效果的影响方面
影响恢复进程： 如果局部出现较严重的红肿感染等情况，可能会影响面瘫的恢复进程，导致恢复时间延长。例如原本预计1 - 2个月能恢复的患者，可能因为局部不良反应而需要3 - 4个月甚至更长时间才能完全恢复。增加心理负担： 出现副作用会给患者带来心理压力，可能影响患者的治疗依从性，进而间接影响面瘫的治疗效果。患者可能会因为担心副作用而对后续治疗产生担忧，从而影响康复的积极性。