肾穿刺活检对身体的伤害通常较小。一般来说，在规范操作下，多数人恢复良好，但仍存在一些可能的情况需要关注。
出血风险方面
肾穿后可能出现血尿，多数为镜下血尿，肉眼血尿一般在1 - 2天内消失。少数情况下可能出现肾周血肿，若血肿较小，通常可自行吸收；但个别严重者可能需要特殊处理。对于有凝血功能障碍等基础疾病的人群，出血风险相对较高，需格外谨慎。
疼痛感受方面
部分患者肾穿后会有腰部酸痛不适，一般数天内可缓解。年轻患者对疼痛的敏感度可能相对低一些，而老年患者可能感觉相对明显，但大多都在可耐受范围内。
感染情况
肾穿后发生感染的概率较低，不过对于免疫力低下的人群，如患有糖尿病且血糖控制不佳等情况时，感染风险会有所增加，需加强术后监测。
对肾功能影响
正常情况下，肾穿对肾功能不会造成明显损害。但如果患者本身肾功能已经严重受损，肾穿操作一般也不会进一步加重其已有的严重肾功能恶化情况，不过仍需根据具体病情综合评估。
总体而言，肾穿是一种有创检查，但在严格掌握适应证和规范操作下，其益处往往大于潜在的微小风险，对于明确肾脏疾病诊断、指导治疗和判断预后具有重要价值。