怀孕3个月时进行流产，可能会对身体造成一定的危害，包括以下几个方面：
1.出血：流产可能会导致子宫出血，出血量可能较多，需要进行清宫等进一步处理。
2.感染：流产手术可能会引起子宫内膜炎、盆腔炎等感染，严重时可能会导致败血症。
3.子宫穿孔：手术过程中可能会出现子宫穿孔，需要进行手术修补。
4.内分泌失调：流产后，体内激素水平会发生变化，可能会导致月经失调、闭经等。
5.再次妊娠问题：流产可能会对子宫内膜造成损伤，增加再次妊娠时流产、早产、胎盘粘连等并发症的风险。
6.心理影响：流产对女性的心理也可能造成一定的影响，如焦虑、抑郁等。
需要注意的是，每个人的身体状况和流产情况都不同，具体的危害也可能因个体差异而有所不同。在决定进行流产手术前，建议咨询医生，了解手术的风险和注意事项，并在医生的指导下进行决策。此外，流产后需要注意休息，避免劳累和感染，按照医生的建议进行复查和后续治疗。如果出现异常症状，如发热、腹痛、阴道流血过多等，应及时就医。同时，在进行性行为时，应采取有效的避孕措施，以避免再次意外怀孕和流产的发生。