孕早期有咖啡色分泌物是不正常的，可能是以下原因引起的：
1.先兆流产：在孕早期，咖啡色分泌物可能是先兆流产的迹象。这可能是由于胚胎染色体异常、母体激素分泌不足、子宫畸形或受到外界刺激等原因导致的。需要及时就医，医生可能会建议卧床休息、使用孕激素等保胎治疗。
2.异位妊娠：受精卵着床在子宫以外的部位，称为异位妊娠。其中，最常见的是输卵管妊娠。宫外孕可能导致阴道流血，颜色可为咖啡色。这种情况非常危险，需要立即就医，进行手术或药物治疗，以避免破裂引起大出血。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜的增生突出于宫颈外口形成的赘生物。息肉表面脆弱，容易因摩擦而引起出血，导致咖啡色分泌物。医生通常会在孕期进行处理，以减少出血和感染的风险。
4.其他原因：葡萄胎、胎盘前置、宫颈炎等也可能导致孕早期出现咖啡色分泌物。
需要注意的是，每个孕妇的情况都可能不同，如果出现咖啡色分泌物，应及时就医，进行详细的检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情舒畅，遵循医生的建议进行治疗和随访。如果分泌物伴有腹痛、大量出血或其他异常症状，应立即急诊就医。