流行性乙型脑炎的主要传染源是猪。在我国，猪是乙型脑炎病毒的主要中间宿主和传染源，因为猪感染乙型脑炎病毒后，病毒可在猪体内大量增殖，且猪的饲养面广、更新率快，使得猪成为人群乙型脑炎病毒的主要传播来源。
猪作为主要传染源的特点
猪的感染普遍性： 猪对乙型脑炎病毒易感，且感染后病毒血症期较长，能大量排出病毒。在乙脑流行地区，猪的感染率可高达100%。猪的饲养环境因素： 猪的饲养环境通常比较密集，比如农村的养猪场或者一些集中养殖的区域，这种密集的环境有利于病毒在猪群中传播，进而增加了向人类传播的风险。
其他可能的传染源
其他家畜： 牛、马、羊等家畜也可能感染乙型脑炎病毒，但它们作为传染源的作用相对猪来说较小。家畜感染乙型脑炎病毒后，病毒血症持续时间较短，排出病毒的量也较少。例如，牛感染乙脑病毒后，一般病毒血症期较短，且病毒载量相对猪低很多。家禽： 鸡、鸭等家禽也有感染乙型脑炎病毒的报道，但它们感染后大多为隐性感染，即感染后不出现明显的临床症状，但仍可能排出病毒。不过，家禽作为传染源的意义不大，因为其排出病毒的量和持续时间都有限。
人群易感性与预防
人群易感性： 人群对乙型脑炎病毒普遍易感，但感染后多数人呈隐性感染，只有少数人会发病。儿童感染后发病的几率相对较高，不过通过预防接种等措施可以有效降低人群的易感性。预防措施： 控制猪的乙脑病毒感染是预防人群乙型脑炎的重要环节。比如在乙脑流行季节前，对猪进行疫苗接种，降低猪群的病毒携带率。同时，个人也要注意防蚊灭蚊，使用蚊帐、蚊香等，避免被蚊虫叮咬，这也是预防乙型脑炎的重要措施。