EB病毒感染目前尚无特效治疗药物，主要采取对症支持治疗。一般来说，大部分免疫功能正常的EB病毒感染者，经过2-4周左右的时间可自行恢复。
对症支持治疗为主
休息与隔离： 患者需要多休息，避免劳累，并且在急性期适当隔离，防止病毒传播给他人。比如发热、乏力明显时，每天保证至少8小时以上的充足睡眠。退热治疗： 如果出现发热症状，体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚等药物进行退热。对乙酰氨基酚适用于大多数EB病毒感染引起发热的患者，但要注意按照说明书的剂量使用，避免过量。
抗病毒药物的应用
更昔洛韦： 对于免疫缺陷者发生的EB病毒感染，可考虑使用更昔洛韦。它能抑制EB病毒的复制，但使用时需要密切监测血常规等指标，因为可能会引起骨髓抑制等不良反应。阿昔洛韦： 阿昔洛韦对EB病毒也有一定的抑制作用，可用于病情较轻的EB病毒感染患者，但疗效相对更昔洛韦可能稍弱一些。
并发症的治疗
肝损害的处理： 如果EB病毒感染导致肝功能异常，出现转氨酶升高等情况，可使用护肝药物，如复方甘草酸苷。需要定期复查肝功能，根据指标调整用药。脾大相关情况： 当出现脾大时，要避免剧烈运动，防止脾破裂。如果脾大引起明显不适或怀疑有破裂风险，需要进一步评估并采取相应措施。