不咳嗽不流鼻涕只发烧可能由多种原因引起，比如感染性因素中的病毒感染（如流感病毒、EB病毒等感染）、细菌感染（如肺炎链球菌等感染），非感染性因素中的自身免疫性疾病（如幼年特发性关节炎等）等。
一、感染性发热之病毒感染
病毒感染是常见原因。像流感病毒感染，在特定季节易引发，儿童等人群易感染，主要是病毒侵入人体后，刺激免疫系统产生反应导致发热，此时可能仅表现为单纯发热，无咳嗽、流鼻涕等上呼吸道卡他症状。
二、感染性发热之细菌感染
细菌感染也可致单纯发热。例如肺炎链球菌引起的肺部感染，早期可能先出现发热，而咳嗽、流鼻涕等症状可能尚未明显表现出来，这是因为细菌感染人体后，机体的免疫反应首先以发热来应对。
三、非感染性发热之自身免疫性疾病
自身免疫性疾病也会导致不咳嗽不流鼻涕只发烧。以幼年特发性关节炎为例，儿童是高发人群，由于自身免疫系统错误攻击自身组织，引发炎症反应，从而出现发热症状，且初期可能不伴有咳嗽、流鼻涕表现。
四、其他可能情况
还有一些少见情况，比如中暑，在高温环境下，人体体温调节失衡，也会出现只发烧，而无咳嗽、流鼻涕的情况，尤其在儿童、老年人等体温调节功能较弱人群中更易发生。