月经没干净就同房，可能会引起盆腔炎、子宫内膜异位症等疾病，危害较大。
月经是女性的正常生理现象，在此期间，子宫内膜会脱落，子宫颈口处于开放状态。如果在月经期间同房，男性生殖器可能会把细菌带入阴道内，经血是细菌等微生物的良好培养基，细菌极易滋生，沿子宫内膜内许多微小伤口和破裂的小血管扩散，感染子宫内膜，甚至可累及输卵管和盆腔器官，从而给女方带来不必要的麻烦。
另外，月经期间同房，由于性冲动时子宫收缩，还可能将子宫内膜碎片挤入盆腔，引起子宫内膜异位症，导致不孕症的发生。
因此，为了女性的健康，建议在月经干净2-3天后再同房。