肩膀疼可能由多种原因引起，因此需要根据具体情况选择相应的科室。以下是一些可能的科室选择：
1.骨科：如果肩膀疼是由于肩部骨骼、关节或肌肉损伤引起的，如骨折、脱位、肩周炎、肩袖损伤等，应首先就诊骨科。骨科医生会进行详细的身体检查、影像学检查（如X光、CT、MRI等），以确定疼痛的原因，并制定相应的治疗方案。
2.疼痛科：如果肩膀疼较为严重，影响日常生活和工作，或经过其他科室治疗后效果不佳，可以考虑就诊疼痛科。疼痛科医生会采用多种方法缓解疼痛，如药物治疗、物理治疗、神经阻滞、微创介入治疗等。
3.风湿免疫科：如果肩膀疼伴有其他症状，如发热、关节肿胀、晨僵等，可能是风湿性疾病引起的，如类风湿关节炎、强直性脊柱炎等。此时应就诊风湿免疫科，进行相关检查和治疗。
4.康复科：康复科医生会根据患者的具体情况，制定个性化的康复方案，包括物理治疗、运动治疗、手法治疗等，帮助患者恢复肩部功能。
5.神经内科：如果肩膀疼伴有上肢麻木、无力、疼痛等症状，可能是神经系统疾病引起的，如颈椎病、胸廓出口综合征等。此时应就诊神经内科，进行相关检查和治疗。
需要注意的是，以上科室的选择仅供参考，具体科室还需根据患者的具体情况和医生的建议进行选择。此外，对于一些特殊人群，如老年人、孕妇、患有其他疾病的患者等，就诊科室可能会有所不同。因此，在就诊前最好咨询医生或医院的导诊台，以便得到更准确的建议。
总之，肩膀疼的原因复杂，治疗方法也因人而异。如果出现肩膀疼，应及时就医，明确诊断，以便得到更有效的治疗。同时，在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，注意休息和保暖，避免肩部过度劳累和受伤。