同房后小肚子疼可能是盆腔炎、黄体破裂、子宫内膜异位症等原因所致，可以通过B超、血常规等检查明确病因，针对治疗。具体分析如下：
1.盆腔炎：女性生殖系统有自然的防御功能，在正常情况下，能抵御细菌的入侵，只有当机体的抵抗力下降，或由于其他原因使女性的自然防御功能遭到破坏时，才会导致盆腔炎的发生。盆腔炎多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。下生殖道感染是盆腔炎的主要诱因，如有阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等，上行感染可导致盆腔炎。此外，宫腔内手术操作后感染、经期卫生不良、感染性传播疾病等也可引起盆腔炎。患者主要表现为下腹痛、阴道分泌物增多，腹痛为持续性，活动或性交后加重。如果炎症累及到输卵管，还可能导致输卵管堵塞，引起不孕症。
2.黄体破裂：黄体破裂是妇科常见的急腹症之一，好发于14～30岁的年轻女性，多发生在月经周期的第20～26天，即下次月经来潮前一周左右。正常情况下，黄体内有少量出血，但如果出血太多，就可能增加黄体内的压力，从而发生自发性破裂。剧烈运动、下腹受到撞击、用力咳嗽或解大便时，腹腔内压力突然升高，可促使成熟的黄体发生破裂。此外，性生活时女性生殖器官扩张充血，黄体内张力升高，加上男方动作粗鲁，妇方下腹部受到强烈的冲击，也可导致黄体破裂。患者多在性交后突然发生一侧下腹剧痛，短时间后变为持续性坠痛，可逐渐减轻或又加剧。疼痛还可能波及到全腹，如果出血量多，还可能出现肛门坠胀、恶心、呕吐等症状。
3.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，称为子宫内膜异位症。异位的子宫内膜可侵犯全身任何部位，如脐、膀胱、肾、输尿管、肺、胸膜、乳腺，甚至手臂、大腿等处，但绝大多数位于盆腔脏器和壁腹膜，以卵巢、宫骶韧带最常见，其次为子宫及其他脏腹膜、阴道直肠隔等部位。子宫内膜异位症多发生于生育年龄的女性，青春期前不发病，绝经后异位病灶可逐渐萎缩退化。子宫内膜异位症的发病机制尚不完全清楚，目前认为是经血逆流、子宫内膜种植学说，即月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢和盆腔腹膜，并在该处继续生长、蔓延，形成盆腔子宫内膜异位症；也有学者认为异位内膜来自体腔上皮化生。此外，免疫学说、遗传因素也可能与子宫内膜异位症的发病有关。子宫内膜异位症的主要症状是痛经、性交痛、慢性盆腔痛、月经异常等。
4.其他：同房后小肚子疼还可能与其他因素有关，如排卵期腹痛、子宫肌瘤、卵巢肿瘤、膀胱炎、尿道炎等。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，勤换内裤，避免食用辛辣、刺激性食物。可适当食用富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、香蕉等。同时，应避免过度劳累和剧烈运动，保证充足的睡眠。