卵泡萎缩和卵泡排出可以通过超声监测、症状表现来区分。一般通过超声检查可以较为准确地判断卵泡是萎缩还是排出。
通过超声监测区分
卵泡排出时：超声下可见卵泡消失，并且盆腔可能会有少量积液。正常成熟卵泡大小约18 - 25毫米，当卵泡排出时，能看到卵泡壁塌陷，卵泡液流入盆腔。卵泡萎缩时：超声下可见卵泡持续存在，但逐渐变小，直径可能小于18毫米，且没有卵泡排出的相关表现。
从症状表现区分
卵泡排出相关表现：部分女性在卵泡排出时可能会有轻微的下腹隐痛，这是因为卵泡排出时卵泡液刺激腹膜引起的，一般疼痛较轻微，持续时间较短。还有可能出现白带增多，呈拉丝状，这是因为雌激素水平升高，宫颈黏液分泌增加导致的。卵泡萎缩相关表现：卵泡萎缩通常没有明显的特殊症状，可能月经周期会受影响，比如月经可能会推迟或者月经量有所变化，但这也不是绝对的，因为月经周期还受其他多种因素影响。
从激素水平变化区分
卵泡排出时激素变化：在卵泡排出前，促黄体生成素会出现高峰值，一般在排卵前24 - 48小时左右达到高峰，然后促使卵泡排出。排卵后雌激素和孕激素水平会逐渐升高。卵泡萎缩时激素变化：卵泡萎缩时，激素水平可能没有出现正常排卵时的这种规律性变化，促黄体生成素没有出现明显的高峰值，雌激素和孕激素的波动也不符合正常排卵后的变化规律。