阿莫西林胶囊是常用的抗生素，但其也可能带来一些副作用。一般来说，约5% - 10%的人使用阿莫西林可能出现胃肠道反应。
胃肠道方面的副作用
恶心、呕吐： 部分人服用阿莫西林后会感觉恶心，严重时可能出现呕吐症状。这是因为药物对胃肠道黏膜有一定刺激，打乱了胃肠道正常的消化功能节奏。比如有些患者在服药后不久，就会感到胃部不适，有想呕吐的感觉。腹泻： 阿莫西林可能引起肠道菌群失调，从而导致腹泻。轻者可能是大便次数比平时增多，重者可能会出现较为频繁的水样腹泻。例如有的患者服用后一天腹泻3 - 5次，且大便不成形。
过敏相关的副作用
皮疹： 过敏反应中比较常见的是皮疹。表现为皮肤出现红色的小疙瘩，可能伴有瘙痒。有些人是在服药后数小时或数天内出现，皮疹的形态多样，有的是散在分布，有的可能融合成片。过敏性休克： 虽然发生概率较低，但却是非常严重的过敏反应。会出现呼吸困难、面色苍白、血压下降等症状，如果不及时抢救，可能危及生命。比如极少数患者在使用阿莫西林后，迅速出现呼吸困难，喉部有堵塞感，同时血压急剧下降。
血液系统的影响
血小板减少： 长期或大剂量使用阿莫西林可能影响血小板的功能或生成，导致血小板数量减少。患者可能会出现皮肤瘀点、瘀斑，刷牙时容易牙龈出血等症状。嗜酸性粒细胞增多： 部分人服用阿莫西林后，血液中的嗜酸性粒细胞会增多。不过一般来说，单纯的嗜酸性粒细胞增多如果没有其他不适症状，可能不需要特殊处理，但需要密切观察血常规的变化情况。