HCG小于3却怀孕了可能是以下原因导致的：
1.检测时间过早：受精卵着床后，HCG水平会逐渐升高，但在受孕后的早期，HCG水平可能还较低，检测结果可能不准确。如果在受孕后的早期进行检测，可能会出现HCG小于3的情况。建议在受孕后14天左右进行检测，以获得更准确的结果。
2.异位妊娠：受精卵在子宫以外的部位着床，称为异位妊娠。异位妊娠时，HCG水平可能较低，因此检测结果可能不准确。异位妊娠是一种危险的情况，可能导致大出血和其他并发症。如果怀疑异位妊娠，应及时就医进行进一步的检查和治疗。
3.其他因素：某些疾病或药物可能会影响HCG水平，导致检测结果不准确。例如，某些肿瘤、自身免疫性疾病、卵巢早衰等疾病可能导致HCG水平升高。某些药物，如促排卵药物、保胎药物等，也可能影响HCG水平。如果怀疑有其他因素影响HCG水平，应及时告知医生。
需要注意的是，HCG小于3并不一定意味着没有怀孕，也不能排除宫外孕的可能。建议及时就医，进行进一步的检查和咨询，以确保母婴的健康。