卵巢囊肿是否能自愈以及如何治疗，需要根据卵巢囊肿的性质、大小、症状等因素来决定。
1.生理性卵巢囊肿：可能会自行消失。
滤泡囊肿和黄体囊肿是最常见的生理性卵巢囊肿。滤泡囊肿是由于卵泡发育和排卵后黄体形成过程中，卵泡液潴留所致；黄体囊肿则是由于排卵后黄体持续存在并扩张所致。这些囊肿通常在2~3个月经周期后自行消退，无需治疗。
注意事项：生理性卵巢囊肿通常较小，无明显症状，一般在体检或因其他原因做超声检查时发现。如果囊肿较大或出现腹痛、月经紊乱等症状，需要进一步检查和治疗。
2.病理性卵巢囊肿：一般不会自愈，需要治疗。
卵巢肿瘤：包括良性肿瘤和恶性肿瘤。良性肿瘤如卵巢纤维瘤、浆液性囊腺瘤等，通常需要手术治疗。恶性肿瘤如卵巢癌，则需要根据肿瘤的分期和患者的情况进行手术、化疗、放疗等综合治疗。
注意事项：病理性卵巢囊肿需要通过超声、肿瘤标志物等检查进行诊断。如果怀疑有卵巢肿瘤，应及时就医，进行进一步检查和治疗。
3.其他情况：
子宫内膜异位症：可导致卵巢巧克力囊肿，这种囊肿通常不会自愈。治疗方法包括药物治疗和手术治疗，手术治疗可选择腹腔镜手术或开腹手术。
多囊卵巢综合征：可出现卵巢多囊样改变，但不一定有卵巢囊肿。治疗方法包括调整生活方式、药物治疗（如避孕药、胰岛素增敏剂等）和手术治疗（如腹腔镜卵巢打孔术）。
总之，卵巢囊肿的治疗方法因病因而异。如果发现卵巢囊肿，应及时就医，医生会根据具体情况制定合适的治疗方案。同时，定期复查也是非常重要的，以便及时发现囊肿的变化。