精神分裂症病人主要根据临床症状来选择用药。以幻觉，妄想，兴奋躁闹等阳性症状微主的病人可选择利培酮，奥氮平，喹硫平，齐拉西酮，氨磺必利，氯丙嗪，氟哌啶醇，奋乃静，氯氮平等药物治疗。
其中氯氮平不作为首选。思维贫乏，情感淡漠，意志缺乏等阴性症状为主的病人可选择阿立哌唑，氨磺必利，齐拉西酮，奥氮平，喹硫平等治疗。
而对于伴有高血压，糖尿病等代谢性疾病及肥胖病人不建议应用奥氮平，氯氮平治疗。伴发脑血管疾病的病人可选用喹硫平治疗。
吸烟的病人不建议应用奥氮平治疗。有肝功能损坏的病人可选用棕榈酸帕利哌酮治疗。月经延迟，闭经，泌乳的病人可选用阿立哌唑，齐拉西酮，喹硫平等治疗。