保妇康栓和干扰素栓配合使用需根据具体病情等情况安排。一般可在医生指导下，选择合适时间分别使用。
病毒感染合并炎症情况
若存在人乳头瘤病毒（HPV）感染同时伴有阴道炎症，可先使用干扰素栓发挥抗病毒作用，间隔一段时间后再使用保妇康栓改善阴道炎症状况。但具体间隔时间需遵医嘱，因为不同个体病情不同。
不同病程阶段配合
处于疾病初期，可先使用干扰素栓针对病毒等病因干预，随着病情进展，在医生评估后可能加入保妇康栓协同改善局部不适等症状。而对于病程较长者，配合使用时要依据病情变化由医生调整使用顺序和时间等。
特殊人群注意
孕妇等特殊人群使用时需格外谨慎，孕妇一般不建议自行使用这两种栓剂，必须在医生充分评估利弊后，严格遵医嘱决定是否配合使用及具体用法，因为孕妇身体状况特殊，任何药物使用都可能对胎儿产生影响。
用药期间注意事项
在配合使用两种栓剂期间，要保持外阴清洁，避免性生活，防止交叉感染等情况发生。同时要密切观察用药后的反应，如出现局部严重不适等异常情况，应及时就医调整用药方案。