小孩发烧39℃是否严重，取决于孩子的年龄、精神状态、基础疾病等情况，不能一概而论，具体分析如下：
1.不严重的情况：
3个月到3岁的小孩，在感染流感病毒后，容易出现高热惊厥。如果孩子发烧39℃，但精神状态好，能吃能玩，这种情况通常不严重，可以先在家观察，多喝水，物理降温，同时密切监测体温变化。
孩子发烧39℃，但基础疾病控制良好，如先天性心脏病、哮喘等，孩子精神状态好，无明显不适，这种情况也不严重，可以在医生的指导下使用退烧药，并密切观察病情变化。
2.严重的情况：
孩子发烧39℃，同时伴有精神萎靡、呼吸急促、呼吸困难、抽搐、意识不清等症状，这种情况通常比较严重，可能是感染严重、肺炎、脑炎等疾病引起的，需要及时就医，明确病因，并进行针对性治疗。
孩子发烧39℃，但有高热惊厥史，这种情况也比较严重，需要在医生的指导下使用退烧药，并密切观察体温变化，必要时进行药物或物理降温，以预防高热惊厥的发生。
孩子发烧39℃，同时伴有基础疾病，如先天性心脏病、哮喘等，且基础疾病控制不佳，这种情况也比较严重，需要及时就医，在医生的指导下使用退烧药，并积极治疗基础疾病，以控制病情。
需要注意的是，小孩发烧39℃时，家长应密切观察孩子的病情变化，如果孩子出现精神萎靡、呼吸急促等症状，应及时就医。同时，家长应给孩子多喝水，以补充水分，促进毒素排出。