指甲凹凸不平可能是营养不良、真菌感染、扁平苔藓等原因引起的，需要根据具体病因进行治疗，以下是一些常见的治疗方法：
1.营养不良：如果指甲凹凸不平是营养不良引起的，可以在医生的指导下补充维生素、矿物质等营养物质。同时，还需要注意饮食均衡，多吃富含蛋白质、维生素和矿物质的食物，如肉类、蛋类、蔬菜、水果等。
2.真菌感染：如果指甲凹凸不平是真菌感染引起的，可以使用抗真菌药物进行治疗，如酮康唑、克霉唑等。同时，还需要注意个人卫生，保持指甲清洁干燥，避免与他人共用指甲刀、毛巾等物品。
3.扁平苔藓：如果指甲凹凸不平是扁平苔藓引起的，可以使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物进行治疗。同时，还需要注意避免搔抓和刺激患处，以免加重病情。
需要注意的是，指甲凹凸不平的原因可能比较复杂，需要根据具体情况进行诊断和治疗。如果指甲凹凸不平的情况比较严重或持续时间较长，建议及时就医，以便获得更好的治疗效果。