乙肝小三阳有癌变的可能，但并非所有小三阳都会癌变，其癌变几率受多种因素影响。
病毒持续活跃复制
若乙肝小三阳患者体内乙肝病毒持续活跃复制，会不断损伤肝细胞，长期反复的肝细胞损伤修复过程中，增加了细胞发生异常突变进而癌变的风险。例如长期病毒载量高的患者，相较于病毒载量低且稳定的患者，癌变可能性相对更高。
不良生活方式影响
长期酗酒、熬夜、过度劳累等不良生活方式会加重肝脏负担，影响肝脏的正常代谢和修复功能，协同乙肝病毒作用，提高癌变几率。比如长期酗酒者，酒精和乙肝病毒双重损害肝脏，比不酗酒的小三阳患者更易走向癌变。
年龄因素作用
随着年龄增长，人体各项机能包括肝脏的代偿修复能力逐渐下降，乙肝小三阳患者年龄越大，发生癌变的潜在风险相对越高。一般中老年小三阳患者相较于年轻小三阳患者，癌变风险有一定程度升高。
基础疾病叠加
若乙肝小三阳患者同时合并其他肝脏基础疾病，如脂肪肝、自身免疫性肝病等，多种肝病因素共同作用，会显著提升癌变的发生概率。例如乙肝小三阳合并脂肪肝的患者，肝脏损伤程度更严重，癌变可能性较单纯乙肝小三阳患者增大。