早上起来咳嗽可能由多种原因引起。比如，约有10%-30%的慢性咳嗽患者是因咳嗽变异性哮喘导致早上起来咳嗽，这是一种特殊类型的哮喘，以咳嗽为唯一或主要症状。
环境因素导致
空气干燥： 如果室内空气湿度较低，比如低于40%，夜间睡眠时呼吸道黏膜会因缺水变得敏感，早上起来就容易引发咳嗽。建议使用加湿器，将室内湿度保持在40% - 60%之间。过敏原刺激： 床上可能有尘螨等过敏原，一晚上的接触后，早上起来接触到这些过敏原就会刺激呼吸道引起咳嗽。要经常清洗床单、被罩，使用防螨床品等。
上呼吸道疾病引发
鼻炎： 患有鼻炎时，夜间鼻涕会倒流至咽喉部，早上起来刺激呼吸道导致咳嗽。过敏性鼻炎患者早上起来咳嗽可能更明显，可使用生理盐水冲洗鼻腔来缓解。咽炎： 慢性咽炎患者咽喉部黏膜处于敏感状态，早上起来可能因分泌物刺激出现咳嗽，要注意清淡饮食，避免吃辛辣、刺激性食物。
消化系统问题导致
胃食管反流： 睡眠时平躺姿势可能导致胃酸反流至食管，刺激咽喉，早上起来就会咳嗽。一般反流性食管炎患者易出现这种情况，平时要注意避免睡前2 - 3小时进食，睡觉时可将床头抬高15 - 20厘米。